تقع وحدة القسطرة المخية بالدور الثاني علوي وتستخدم القسطرة المخية لعلاج حالات: جلطات المخ، تركيب دعامات بشـرايين المخ الضيقة، علاج التمددات الشـريانية، علاج الوحمات المخية والشوكية، بعض حالات الاورام المخية ما قبل الجراحة ويتولى الإشراف الفني على هذه الوحدات تخصصات: الأشعة التداخلية وطب وجراحة المخ والأعصاب، وملحق بوحدة القسطرة المخية عناية متوسطة لاستقبال المريض ومتابعته بعد عمل إجراء القسطرة ومجهزة بجهاز تنفس صناعي ومونيتور لقياس المعدلات الحيوية للمريض وجهاز صدمات.